Quartz 4

Zotero Integration Workflow

3 min read

Zotero Integration Workflow

Mục tiêu

Thiết lập một workflow trong đó Zotero quản lý paper, citation và PDF; còn Obsidian lưu phần hiểu, tổng hợp, concept và tiến trình nghiên cứu.

Vai trò từng công cụ

  • Zotero: lưu metadata, citation key, collection, tag, PDF và annotation gốc.
  • Google Drive: sync file PDF nếu muốn dùng linked files trên nhiều máy.
  • Obsidian: lưu paper note, paper reading log, literature note, research question và concept.

Cấu trúc thư mục nên dùng

Trong vault:

00 - Sources/PDFs/Papers
20 - Research/Papers
20 - Research/Paper Reading
20 - Research/Literature Notes
20 - Research/Research Questions
04 - Concepts

Nếu dùng Google Drive để sync PDF ngoài vault:

Google Drive/Zotero PDFs/Papers
Google Drive/Zotero PDFs/Books

Cấu hình Zotero

Không đặt toàn bộ Zotero data directory vào Google Drive. Thư mục này chứa zotero.sqlite, nếu sync bằng Google Drive/Dropbox/OneDrive có thể gây lỗi database.

Nên dùng một trong hai cách:

  • Cách đơn giản: dùng Zotero Sync cho metadata và Zotero Storage hoặc WebDAV cho PDF.
  • Cách tiết kiệm dung lượng Zotero: để PDF trong Google Drive và attach vào Zotero bằng linked file.

Linked files với Google Drive

Khi dùng Google Drive cho PDF:

  1. Lưu PDF vào Google Drive/Zotero PDFs/Papers.
  2. Trong Zotero, chọn item paper.
  3. Chọn kẹp giấy hoặc right click item.
  4. Chọn Attach Link to File....
  5. Trỏ tới PDF trong Google Drive.
  6. Vào Settings -> Advanced -> Files and Folders.
  7. Đặt Linked Attachment Base Directory tới thư mục Google Drive/Zotero PDFs.

Lưu ý: Zotero không sync linked files. Google Drive chịu trách nhiệm sync PDF, Zotero chỉ sync metadata và đường dẫn tương đối.

Plugin cần cài

Trong Zotero:

  • Better BibTeX.

Trong Obsidian:

  • Zotero Integration.

Sau khi cài Better BibTeX, mỗi item nên có citekey ổn định, ví dụ leAdaptivePromptingContinual2026.

Workflow paper mới

  1. Thêm paper vào Zotero bằng DOI, arXiv, browser connector hoặc kéo PDF vào Zotero.
  2. Kiểm tra metadata: title, authors, year, venue, DOI/arXiv.
  3. Gắn PDF theo một trong hai kiểu:
    • Stored file nếu để Zotero quản lý.
    • Linked file nếu PDF nằm trong Google Drive.
  4. Lấy citekey từ Zotero.
  5. Tạo note trong 20 - Research/Papers bằng Paper Note.
  6. Điền các trường quan trọng: title, authors, year, venue, pdf, doi, arxiv, zotero_key, citekey.
  7. Khi đọc mỗi phiên, tạo log trong 20 - Research/Paper Reading bằng Paper Reading.
  8. Nếu một ý tưởng xuất hiện nhiều lần, tách thành concept trong 04 - Concepts.

Mẫu liên kết trong paper note

pdf: "[[paper-file-name.pdf]]"
zotero_key:
citekey:
related_concepts:
  - "[[Retrieval-Augmented Generation]]"

Quy tắc đặt tên

  • Paper note: dùng tên paper ngắn, rõ nghĩa.
  • PDF: ưu tiên tên có author-year-title-short.pdf.
  • Paper reading log: dùng ngày hoặc ngày kèm paper, ví dụ 2026-07-23 - Adaptive Prompting.md.
  • Concept: dùng một note canonical, tránh tạo trùng.

Checklist khi nhập paper

  • Paper đã có metadata đầy đủ trong Zotero.
  • PDF đã được attach đúng kiểu.
  • Citekey đã ổn định.
  • Paper note đã tạo trong 20 - Research/Papers.
  • PDF hoặc linked file đã được ghi vào pdf.
  • Concept quan trọng đã được link hoặc tạo mới.
  • Reading log đầu tiên đã tạo nếu bắt đầu đọc ngay.

Liên kết

Graph View

Backlinks